Могу сказать что столкнулся с такой же проблемой, при большой базе, обычная сессия за столами приводила к росту базы на 10-20гб и все свободное место на ссд сжиралось очень быстро. Решения проблемы не нашел, кроме как удалить все базы которые можно было удалить (чтобы на диске было больше места) и пересоздать новую базу с меньшим кол-вом рук.

Вообще неплохо бы какие-то подобные вещи вынести в факью или может быть в уведомления, когда остается мало места на диске с базой.